Ders Öğretim Planı

Ders Kodu Ders Adı Ders Türü Yıl Dönem AKTS
TBG710 Biyoinformatik 927003 1 1 6

Dersin Amacı

Bu ders ikinci yıl Tıbbi Biyoloji Doktora öğrencilerine Biyoinformatik alanının ana kavramları hakkında bilgi verir ve onlara bu alanda kullanılan çeşitli programların ve açık veribankalarının önemini tanıtır.

Ön Koşul Dersleri

Yok

Önerilen Diğer Hususlar

Yok

Ders Kitabı / Malzemesi / Önerilen Kaynaklar

Andreas D. Baxevanis, B. F. Francis Quellette, 1998. Biyoinformatik, John Wiley and Sons, Inc. / Periyodiklerdeki ilgili makaleler.

Staj Durumu

Yok

Dersin İçeriği

Tıp, biyoloji, genetik, proteomik ve genomik veribanklarına girme ve bu bankalardan çeşitli programları kullanarak yararlı bilgileri alma ve kullanma.

Haftalık Ders İçeriği

Hafta Teorik Uygulama Laboratuar Ders Notları
1 Biyoinformatik nedir?
2 ‘National Center for Biotechnology Information (NCBI)’nın tanıtımı
3 GenBank [Nucleic Acids Research, 2013 Jan;41(D1):D36-42]’ın tanıtımı
4 PubMed’in tanıtımı; PubMed’i etkili bir şekilde nasıl kullanabiliriz?)
5 OMIM (Online Mendelian Inheritenve in Man)’in tanıtımı
6 Gene (http://www.ncbi.nlm.nih.gov/gene/) veribankasının tanıtımı
7 RefSeq (NCBI Reference Sequence Database)’in tanıtımı
8 UniGene veribabnkasının tanıtımı
9 SNP veribankası (dbSNP)’nın tanıtımı
10 Genotip ve Fenotip veribankası (dbGAP)’nın tanıtımı
11 BLAST (Basic Local Alignment Sequence Tool) programının tanıtımı
12 BLAST Nükleotid programının kullanımı
13 BLAST Protein programının kullanımı
14 İnsan Genomunun özelliklerinin genel bir özeti
15
16

Bölüm Program Çıktıları

# Program Çıktı Id Açıklama