Ders Öğretim Planı

Ders Kodu Ders Adı Ders Türü Yıl Dönem AKTS
MİK614 Moleküler Mikrobiyoloji 927003 1 2 6

Dersin Amacı

Bu dersin, moleküler mikrobiyolojinin temelleri ve ilkelerine bir giriş olması amaçlanmıştır

Dersin Veren Öğretim Görevlisi/Görevlileri

Yrd.Doç.Dr. Kemal Bilgin

Ön Koşul Dersleri

Yok

Önerilen Diğer Hususlar

Yok

Ders Kitabı / Malzemesi / Önerilen Kaynaklar

– Temizkan G, Arda N. (Eds) Moleküler Mikrobiyolojide Kullanılan Yöntemler. İÜ BİYOGEM No.2., Nobel Tıp Kitabevleri, 2004. – Durmaz R. (Ed) Uygulamalı Moleküler Mikrobiyoloji, Nobel Tıp Kitabevleri, 2001. – Ağaçfidan A, Badur S, Türkoğlu S. (Eds) İnfeksiyon Hastalıklarının Tanısında Moleküler Yöntemler. TMC No: 42, 2002 – Vicente M, Tamares J, Valencia A, Mingorance J. (Eds) Molecules in Time and Space; Bacterial Shape, Division and Phylogeny. Kluwer Academic/Plenum Publishers, 2004. – Dale JW, Park SF, Molecular Genetics of Bacteria, Wiley, 2004. – Synder L, Champness W, Molecular Genetics of Bacteria, ASM Press, 2003. – Ogunseitan O. Microbial Diversity, Blackwell, 2005 – Decker J, Udo Reischl.(Eds.) Molecular Diagnosis of Infectious Diseases, Humana Press, 2004 – Riley LW. Molecular Epidemiology of Infectious Diseases, Principles and Practices, ASM Press, 2004 – Thompson RCA. Molecular Epidemiology of Infectious Diseases, Arnold, 2000. – Carrington M, Hoetzel AR, Molecular Epidemiology, The Practical Approach Series, OUP, 2002 – Hoetzel AR. Molecular Genetic Analysis of Populations, The Practical Approach Series, OUP, 1998 – McPherson MJ, et al. (Eds), PCR, The Practical Approach Series, OUP, 1991 – McPherson MJ, et al. (Eds), PCR 2, The Practical Approach Series, OUP, 1995 – Monaco AP. Pulsed Field Gel Electrophoresis, The Practical Approach Series, OUP, 1995 – van Belkum A, Duim B, Hays JP. (Eds) Experimental Approaches for Assessing Genetic Diversity Among Microbial Pathogens, WET, 2003. – Dijkshoorn L, Towner KJ, Struelens M (Eds), New Approaches for the Generation and Analysis of Microbial Typing Data, Elsevier, 2003. – Fraser CM, Read TD, Nelson KE.(Eds), Microbial Genomes, Humana Press, 2004. – Woodford N, Johnson AP. (Eds), Genomics, Proteomics and Clinical Bacteriology, Humana Press, 2004. – Sambrook J, Russell DW (Eds), Molecular Cloning: A Laboratory Manual, Cold Spring Harbor, 2001. – Primrose SB, Twyman RM, Old RW. Principles of Gene Manipulation. Blackwell Sciences, 2004 – Primrose SB, Twyman RM. Principles of Genome Analysis and Genomics. Blackwell Publishing, 2003. – Westhead DR, Parish JH, Twyman RM. Bioinformatics, Bios, 2002.

Staj Durumu

Yok

Dersin İçeriği

Evrimsel Ekoloji ve Dinamik, Mikrobiyal Genler: Yapı, Organizasyon ve İşlev, Mikrobiyal Genomda Modularite, Mikrobiyal Genomik, Mikrobiyal Popülasyon Dinamiği, Filogenomik

Değerlendirme

# Etkinlikler Adet Yuzde Katkısı Yarıyıl İci Etkinlik Yıl Sonu Etkinlik
90 Yarıyıl (Yıl) İçi Etkinlikleri 0 40
91 Yarıyıl (Yıl) Sonu Etkinlikleri 0 60
1 Ara Sınav 1 100 1
2 Final Sınavı 1 100 1

Ders İş Yükü Verisi

# Etkinlikler Adet Süresi(saat) Toplam İş Yükü(saat)
1 Ara Sınav 1 1 1
2 Final Sınavı 1 1 1
5 Derse Katılım 14 1 14
32 Ara Sınav İçin Bireysel Çalışma 14 5 70
33 Final Sınavı içiin Bireysel Çalışma 14 5 70

Haftalık Ders İçeriği

Hafta Teorik Uygulama Laboratuar Ders Notları
1 Moleküler mikrobiyoloji laboratuvarının dizaynı
2 Moleküler mikrobiyoloji laboratuvarında çalışma prensipleri
3 Ekstraksiyon yöntemi
4 PCR içerik oluşturma
5 PCR optimizasyonu
6 PCR çeşitleri
7 PCR çeşitleri
8 Elektroforez prensipleri
9 PFGE uygulama
10 PFGE yorumlama
11 Dizileme yöntemi
12 Dizileme yöntemi
13 Mikroerrey yöntemi
14 Mikroerrey yöntemi

Dersin Öğrenme Çıktıları

# Öğrenme Çıktı Id Açıklama
1 1254701 Moleküler yöntemlerin prensiplerini bilir.
2 1254702 Moleküler yöntemleri pratik olarak yapmayı bilir.
3 1254703 Moleküler yöntem sonuçlarını yorumlamayı bilir.
4 1254704 Yeni moleküler yöntemleri geliştirebilir.
5 1254705 Moleküler yöntemleri güvenle çalışabilir.

Bölüm Program Çıktıları

# Program Çıktı Id Açıklama
1 67053 Tıbbi Mikrobiyoloji bilim alanında uzmanlık düzeyinde bilgi birikimine sahip olur
2 67054 Mikroskop kullanımı, mikroorganizmaların üretilmesi ve tanımlanması, temel bazı mikrobiyolojik testlerin yapılması konularında beceri sahibi olur
3 67051 Alanıyla ilgili teknolojik gelişmeleri takip eder, mesleki bilgilerini sürekli günceller.
4 67052 Temel Mikrobiyoloji bilgisine sahip olur
5 67055 Alanıyla ilgili teknolojik gelişmeleri takip eder, mesleki bilgilerini sürekli günceller.

Ögrenme Çıktı Matrisi

Program Çıktısı
1 2 3 4 5
Öğrenme Çıktısı
1 5 3 4 3 4
2 5 3 4 3 4
3 5 3 4 3 4
4 5 3 5 3 5
5 5 3 4 3 4
* Katkı Düzeyi : 1 Çok düşük 2 Düşük 3 Orta 4 Yüksek 5 Çok yüksek