Ders Öğretim Planı

Ders Kodu Ders Adı Ders Türü Yıl Dönem AKTS
VSH631 Moleküler İdentifikasyon ve Tiplendirme Yöntemleri 927003 1 2 6

Dersin Amacı

Bakterilerin identifikasyonunda kullanılan moleküler yöntemler ile beraber bakterilerin moleküler tiplendirilmesinin uygulamalı olarak anlatıldığı bir derstir.

Dersin Veren Öğretim Görevlisi/Görevlileri

Prof. Dr. Ertan Emek ONUK

Ön Koşul Dersleri

Yok

Önerilen Diğer Hususlar

Yok

Ders Kitabı / Malzemesi / Önerilen Kaynaklar

1. Abigail, A., Salyers D., Whitt, D. (1994): Bacterial Pathogenesis: A Molecular Approach, ASM Press, Washington, D.C. 2. Arda, M, (1995): Biyoteknoloji (Bazi Temel İlkeler). Kükem Derneği Bilimsel Yayınlar No:3, Ankara. 3. Çevik, A. M. (1994): PCR ve İnfeksiyon Hastalıklarda Kullanımı. Seminer, Ankara Hastanesi Klinik Mikrobiyoloji ve İnfeksiyon Hastalıkları Bölümü. 4. Çiftci, A. (2003): Antimikrobiyel Direncin Genetik Metotlar ile Saptanması. Orlab On-Line Mikrobiyoloji Dergisi.1:22-28. 5. Eisentein, I. B. (1990): New Molecular Techniques for Microbiai Epidemiology and The Diagnosis of Infectious Diseases. J.Inf.Dis, 161:595-602. 6. Rodriguez, J. M. (1997): Detection Of Pathogens By Using The Polymerase Chain Reaction (PCR). Vet.J.,153:287-305. 7. Xu, L., Larzul, D. (1991): The Polymerase Chain Reaction: Basic methodology And Applications. Comp.Immun.Microbiol.Infect.Dis., 14:209-221.

Dersin Sunulduğu Dil

Türkçe

Staj Durumu

Yok

Dersin İçeriği

Dersin içeriğini DNA ve RNA tespitine dayanan PCR tabanlı moleküler yöntemler ve varyasyonları ile beraber genomik ve proteomik tiplendirme yöntemleri oluşturmaktadır.

Değerlendirme

# Etkinlikler Adet Yuzde Katkısı Yarıyıl İci Etkinlik Yıl Sonu Etkinlik
90 Yarıyıl (Yıl) İçi Etkinlikleri 0 40
91 Yarıyıl (Yıl) Sonu Etkinlikleri 0 60
1 Ara Sınav 1 100 1
2 Final Sınavı 1 100 1

Ders İş Yükü Verisi

# Etkinlikler Adet Süresi(saat) Toplam İş Yükü(saat)
1 Ara Sınav 1 2 2
2 Final Sınavı 1 2 2
5 Derse Katılım 16 4 64
6 Uygulama/Pratik 16 1 16
7 Laboratuvar 16 1 16
10 Tartışma 16 1 16
19 Beyin Fırtınası 16 1 16
49 Performans 16 1 16
54 Ev Ödevi 4 2 8

Haftalık Ders İçeriği

Hafta Teorik Uygulama Laboratuar Ders Notları
1 Nükleik asitler ve önemi
2 Polimeraz zincir reaksiyonu ( PZR, PCR)-1
3 Polimeraz zincir reaksiyonu ( PZR, PCR)-2
4 Bir PZR’nin Yapılışı ve Prensipleri-1
5 Bir PZR’nin Yapılışı ve Prensipleri-2
6 Hot Start PZR,In Situ PZR,Invers (Tersine Dönmüş) PZR
7 Multipleks PZR
8 Nested PZR
9 Reverse-tranktriptaz PCR
10 Real-time PCR
11 PZR ile balık patojenlerinin saptanması
12 Moleküler tiplendirme ve önemi
13 Konvensiyonel tiplendirme yöntemleri
14 Protein tabanlı tiplendirme yöntemleri
15 DNA tabanlı tiplendirme yöntemleri
16 PFGE

Dersin Öğrenme Çıktıları

# Öğrenme Çıktı Id Açıklama
1 1309889 Bakterilerin identifikasyonunda kullanılan PCR tabanlı moleküler testleri uygulayabilecek ve yorumlayabileceklerdir.
2 1309890 Bakterilerin tiplendirilmesinde kullanılan protein ve PCR tabanlı moleküler testleri uygulayabilecek ve yorumlayabileceklerdir.

Bölüm Program Çıktıları

# Program Çıktı Id Açıklama
1 70638 Yuksek lisans yeterliliklerine dayalı olarak Su Urunleri Hastalıkları alanındaki guncel ve ileri duzeydeki bilgileri ozgun dusunce ve/veya arastırma ile uzmanlık duzeyinde gelistirebilme, derinlestirebilme ve alanına yenilik getirecek ozgun tanımlara ulasabilme.
2 70639 Su urunlerinde alanındaki yeni bilgileri sistematik bir yaklasımla degerlendirebilme ve kullanabilme.
3 70640 Su urunleri alanına yenilik getiren, yeni bir dusunce, yontem, tasarım ve/veya uygulama gelistirebilme ya da bilinen bir dusunce, yontem, tasarım ve/veya uygulamayı farklı bir alana uygulayabilme, ozgun bir konuyu arastırabilme, kavrayabilme, tasarlayabilme, uyarlayabilme ve uygulayabilme.
4 70642 Alanına ilgili olarak guncellenen her turlu bilgiyi (bilimsel bilgi, mevzuat, vb) takip eder, kullanır ve gerektiginde degistirme yeterliligine sahiptir. Yasam boyu ogrenmeyi ilke edinir ve arastırmaya dayalı bilginin en onemli kazanım oldugunun bilincine sahiptir.
5 70641 Yeni ve karmasık dusuncelerin elestirel analizini, sentezini ve degerlendirmesini yapabilme.
6 70643 Alanının iliskili oldugu disiplinler arası etkilesimi kavrar; yeni ve karmasık fikirleri analiz, sentez ve degerlendirmede uzmanlık gerektiren bilgileri kullanarak ozgun sonuclara ulasır.

Ögrenme Çıktı Matrisi

Program Çıktısı
1 2 3 4 5 6
Öğrenme Çıktısı
1 5 5 5 5 5 5
2 5 5 5 5 5 5
* Katkı Düzeyi : 1 Çok düşük 2 Düşük 3 Orta 4 Yüksek 5 Çok yüksek