Ders Öğretim Planı

Ders Kodu Ders Adı Ders Türü Yıl Dönem AKTS
FMBG628 Prokaryotik Salgı Sistemleri 927003 1 1 7.5

Dersin Amacı

Protein salgı sistemleri makromoleküllerin hücre dışına atılmasında veya hücre içine alınmasında görev yapan en önemli sistemlerdir. Bu ders boyunca proteinlerin membranlar arasında nasıl taşındığını, hücre dışına ve hücre içine nasıl salgılandıklarını anlatılmaya çalışılacaktır. Salgı sistemlerinin biyolojik fonksiyonları da patojen mikroorganizmalara yoğunlaşılarak anlatılacaktır.

Dersin Veren Öğretim Görevlisi/Görevlileri

Dr. Öğr. Üyesi Tuğrul DORUK

Ders Kitabı / Malzemesi / Önerilen Kaynaklar

1) Oudega B (2003). Protein Secretion Pathways in Bacteria. Springer Netherlands 2) Green ER, Mecsas J. Bacterial Secretion Systems – An overview. Microbiology spectrum. 2016;4(1):10.1128/microbiolspec.VMBF-0012-2015. 3) Abby SS, Cury J, Guglielmini J, Néron B, Touchon M, Rocha EPC. Identification of protein secretion systems in bacterial genomes. Scientific Reports. 2016;6:23080.

Dersin Sunulduğu Dil

Türkçe

Dersin İçeriği

Proteinlerin membrana yönlendirilmesi, SEC transfer sistemi, TAT protein taşıma sistemi, Membran proteinlerinin biyogenezi, Şaperonların salgı sistemleri ile ilişkisi, Gram negatif bakterilerde salgı sistemleri, Gram pozitif bakterilerde salgı sistemleri, salgılanan ürünler ve biyolojik işlevleri.

Değerlendirme

# Etkinlikler Adet Yuzde Katkısı Yarıyıl İci Etkinlik Yıl Sonu Etkinlik
90 Yarıyıl (Yıl) İçi Etkinlikleri 1 40
91 Yarıyıl (Yıl) Sonu Etkinlikleri 1 60
1 Ara Sınav 1 60 1
4 Quiz 2 40 1
2 Final Sınavı 1 100 1

Ders İş Yükü Verisi

# Etkinlikler Adet Süresi(saat) Toplam İş Yükü(saat)
1 Ara Sınav 1 2 2
2 Final Sınavı 1 2 2
3 Bütünleme Sınavı 1 2 2
4 Quiz 2 0 1
5 Derse Katılım 12 3 36
28 Makale Kritik Etme 5 3 15
29 Bireysel Çalışma 5 5 25
32 Ara Sınav İçin Bireysel Çalışma 1 48 48
33 Final Sınavı içiin Bireysel Çalışma 1 48 48
52 Quiz için Bireysel Çalışma 2 6 12

Haftalık Ders İçeriği

Hafta Teorik Uygulama Laboratuar Ders Notları
1 Membrana protein yönlendirilmesi
2 SEC translokasyon sistemi
3 TAT protein taşıma sistemi
4 Plazma membran proteinlerinin kurulması
5 Dış membran proteinlerinin biyogenezi
6 Şaperonlar ve protein salgı sistemleri
7 Vize sınavı
8 Tip I protein salgı sistemi
9 Tip II protein salgı sistemi
10 Tip III protein salgı sistemi
11 Ototaşıyıcılar
12 Bakteriyosinlerin taşınması
13 Kamçı yapısının biyogenezi
14 Final sınavı

Dersin Öğrenme Çıktıları

# Öğrenme Çıktı Id Açıklama
1 1299772 Prokaryotik Salgı Sistemleri çeşitlerini açıklar
2 1299773 Membran proteinlerinin biyogenezini açıklar
3 1299774 Şaperonların salgı sistemleri ile etkileşimini açıklar
4 1299775 Salgılanan ürünleri açıklar
5 1299776 Patojenitede salgı sistemlerinin önemini açıklar

Bölüm Program Çıktıları

# Program Çıktı Id Açıklama
1 70329 Alanının gelişmesinde yer alan önemli kişileri, olay ve olguları, alanının uygulamalarına etkileri açısından değerlendirebilir
2 70330 Alanı ile ilgili verilerin toplanması, yorumlanması, uygulanması ve duyurulması aşamalarında toplumsal, bilimsel, kültürel ve etik değerleri gözeterek denetler ve bu değerleri öğretebilir
3 70331 Moleküler biyoloji ve genetik ile ilgili bilimsel süreçlerin temel işleyişlerini ve teorik temellerini açıklar
4 70332 Dünya çapındaki moleküler biyoloji ve moleküler genetik literatürünü okur ve eleştirel bir bakışla literatürde bulunan eksikleri ve problemleri tespit eder
5 70338 Eğitim, endüstri, tarım, sağlık, çevre, enerji ve biyoteknoloji alanlarında disiplinler arası çalışmalara katılır ve diğer disiplinlerin problemleri içindeki moleküler biyoloji ve genetik ögelerini tanır ve açıklar
6 70333 Moleküler biyoloji ve moleküler genetik ile ilgili problemlerin çözümüne yönelik hipotez kurar, uygun istatistiksel yöntemleri seçer ve en güncel deneysel yaklaşımlarla çözer
7 70334 Güncel teorik ve teknolojik gelişmeleri takip eder, yaşam boyu eğitimi kendisine amaç edinir
8 70335 Uzmanlaştığı alanda en az bir yabancı dilde sözlü ve yazılı iletişim kurabilir
9 70336 Alanı ile ilgili konularda strateji, politika ve uygulama planları geliştirir ve elde edilen sonuçları, kalite süreçleri çerçevesinde değerlendirir
10 70337 Moleküler biyoloji ve genetik alanındaki uygulamalarda, toplumsal ve evrensel değerlere duyarlı, ülkenin öncelikli alanlarını gözeten, araştıran ve bu konularda üretim yapan, katkı sağlayan, etik ve sorumluluk sahibidir

Ögrenme Çıktı Matrisi

Program Çıktısı
1 2 3 4 5 6 7 8 9 10
Öğrenme Çıktısı
1 1 2 5 3 3 4 2 1 1 1
2 1 2 5 3 3 4 2 1 1 1
3 1 2 5 3 3 4 2 1 1 1
4 1 2 5 3 3 4 2 1 1 1
5 1 2 5 3 3 4 2 1 1 1
* Katkı Düzeyi : 1 Çok düşük 2 Düşük 3 Orta 4 Yüksek 5 Çok yüksek