Ders Öğretim Planı

Ders Kodu Ders Adı Ders Türü Yıl Dönem AKTS
VSH724 Balık Parazitlerinde Moleküler Tanı Yöntemleri 927003 1 2 6

Dersin Amacı

Bu derste balık parazitlerinin teşhisinde kullanılan moleküler tanı yöntemlerin öğretilmesi amaçlanmıştır.

Dersin Veren Öğretim Görevlisi/Görevlileri

Doç.Dr. Gökmen Zafer Pekmezci

Ön Koşul Dersleri

Yok

Önerilen Diğer Hususlar

Yok

Ders Kitabı / Malzemesi / Önerilen Kaynaklar

1- Protozoan Parasites of Fishes, Editors: Jiří Lom, Iva Dyková, Elsevier, 1992. 2- Fish Diseases and Disorders, Volume 1: Protozoan and Metazoan Infections, Second Edition, Editor: P.T.K Woo, CAB International, USA, 2006. 3- Fish Parasites: Pathobiology and Protection, Editors: P.T.K. Woo, Kurt Buchmann, CAB International, USA, 2012. 4- Fish Disease: Diagnosis and Treatment, Editor: Edward J. Noga, Wiley Blackwell, 2010. 5- Marine Parasitology, Editor: Klaus Rohde, CABI Publishing, 2005. 6- Fish Diseases, Editor: Wilhelm Schäperclaus, H. Kulow, K. Schreckenbach, 1992. 7- Parasitic Worms of Fish. Editor: Hartford Williams, CRC Press, 2002. 8- An Introduction to Practical Methods in Fish Parasitology: Classical and Molecular Techniques. Editor: Kurt Buchmann, Biofolia, 2007. 9- Fish Diseases (2 Vols.), Editor: Jorge Eiras, Helmut Segner, Thomas Wahli, B.G. Kapoor, Science Publishers, 2008. 10- Parasitic Nematodes of Freshwater Fishes of Europe, Editor: F. Moravec, Kluwer Academic Publishers, 1992. 11- Metazoan Parasites of Salmonid Fishes of Europe, Editor: F. Moravec, Academia, 2004.

Dersin Sunulduğu Dil

Türkçe

Staj Durumu

Yok

Dersin İçeriği

Moleküler tanı yöntemlerin genel prensipleri, rutin ve paraziter araştırmalarda kullanım yöntemleri anlatılır.

Değerlendirme

# Etkinlikler Adet Yuzde Katkısı Yarıyıl İci Etkinlik Yıl Sonu Etkinlik
90 Yarıyıl (Yıl) İçi Etkinlikleri 0 40
91 Yarıyıl (Yıl) Sonu Etkinlikleri 0 60
1 Ara Sınav 1 100 1
2 Final Sınavı 1 100 1

Ders İş Yükü Verisi

# Etkinlikler Adet Süresi(saat) Toplam İş Yükü(saat)
1 Ara Sınav 1 5 5
2 Final Sınavı 1 5 5
5 Derse Katılım 14 2 28
6 Uygulama/Pratik 14 2 28
10 Tartışma 14 3 42
19 Beyin Fırtınası 14 3 42

Haftalık Ders İçeriği

Hafta Teorik Uygulama Laboratuar Ders Notları
1 Moleküler çalışmalarda kullanılan cihazların tanıtımı Moleküler Yöntemler-1-2-3.pdf
2 DNA ve RNA izolasyonu Moleküler Yöntemler-1-2-3.pdf
3 Moleküler amplifikasyon teknikleri Moleküler Yöntemler-1-2-3.pdf
4 Primer seçimi Moleküler Yöntemler-4-5.pdf
5 PCR Moleküler Yöntemler-4-5.pdf
6 RFLP (Restriksiyon Fragment Length Polymorphism) RFLP.pdf
7 DNA dizi analizi DNA dizi analizi yöntemleri.pdf
8 Ara sınav
9 DNA dizi analizi DNA dizi analizi yöntemleri.pdf
10 Hibridizasyon yöntemleri Hibridizasyon1.pdf
11 Gerçek zamanlı PZR Gerçek Zamanlı PCR.pdf
12 Moleküler tekniklerin balık parazitolojideki uygulama alanları Pekmezci-1.pdf
Pekmezci-2.pdf
13 Filogenetik analiz Filogenetik analiz-1.pdf
14 Filogenetik analiz filogenetik analiz-2.pdf
15 Filogenetik analizler Filogenetik analiz-3.pdf
16 Final

Dersin Öğrenme Çıktıları

# Öğrenme Çıktı Id Açıklama
1 1523308 Bu dersin sonunda öğrenciler Balık parazitlerinin moleküler identifikasyonu hakkında bilgi sahibi olup bu teknikleri kullanabilir.
2 1523309 Kan ve doku örneklerinden DNA ekstraksiyonu yapabilir.
3 1523306 PCR, nested-PCR, qPCR,RFLP gibi tekniklerini yapabilir.
4 1523307 Bütün bu tekniklerin balıkların paraziter hastalıklarda nasıl kullanılacağını açıklayabilir.

Bölüm Program Çıktıları

# Program Çıktı Id Açıklama
1 78320 Alanına ilgili olarak guncellenen her turlu bilgiyi (bilimsel bilgi, mevzuat, vb) takip eder, kullanır ve gerektiginde degistirme yeterliligine sahiptir. Yasam boyu ogrenmeyi ilke edinir ve arastırmaya dayalı bilginin en önemli kazanım olduğunun bilincine sahiptir.
2 78321 Alanına ilgili bilinen/ yeni tanımlanan sorunlara cozum olusturma amacıyla gerektiginde disiplinler arası alanda bir arastırma projesi planlayarak, ekip olusturur, ekip bilinci icerisinde proje yurutur ve sonuclandırır.
3 78322 Egitim aldıgı alanda edindigi uzmanlık duzeyindeki kuramsal ve uygulamalı bilgileri kullanarak, alana ozgun laboratuvar, klinik ve benzeri becerileri ustalasmıs duzeyde gerceklestirir ve alana ilgili sorunlarda cozum olusturabilme becerisine sahiptir.
4 78323 Uzmanlık alanına yonelik guncel literatürleri takip eder, yorumlar ve etkili bir sekilde pratige aktarabilir
5 78319 Alanı ile ilgili verilerin toplanması, yorumlanması, uygulanması ve duyurulması asamalarında toplumsal, bilimsel, kulturel ve etik degerleri gozeterek denetler ve bu degerleri ogretir.
6 78324 Alanının iliskili oldugu disiplinler arası etkilesimi kavrar; yeni ve karmasık fikirleri analiz, sentez ve degerlendirmede uzmanlık gerektiren bilgileri kullanarak ozgun sonuclara ulasır.

Ögrenme Çıktı Matrisi

Program Çıktısı
1 2 3 4 5 6
Öğrenme Çıktısı
1 5 5 5 5 5 5
2 5 5 5 5 5 5
3 5 5 5 5 5 5
4 5 5 5 5 5 5
* Katkı Düzeyi : 1 Çok düşük 2 Düşük 3 Orta 4 Yüksek 5 Çok yüksek